В счете-фактуре  прослеживаемые товары в составе работ можно не выделять

ФНС рассмотрела вопрос заполнения счета-фактуры по прослеживаемым товарам в составе выполненных работ. Налоговики отметили, что действующий порядок заполнения счетов-фактур не устанавливает какие-либо правила для этого случая. Следовательно, такая обязанность не установлена. Однако правила заполнения не содержат и запрета на отражение прослеживаемых товаров в составе работ. При заполнении счета-фактуры организация может указать прослеживаемые товары в отдельных строках под строкой с наименованием работы, в которой использованы эти товары. Тогда в строках с прослеживаемыми товарами нужно проставить реквизиты прослеживаемости в графах 11—13 счета-фактуры. В этом случае такое заполнение соответствует действующим правилам.