Ученые объяснили загадку популярного сорта кофе
Родиной кофе считается Эфиопия. Новое исследование, проведенное международной группой ученых, подтвердила эту теорию, а также выяснило, когда именно на территории современной Эфиопии появилось растение, из зерен которого сегодня готовят кофе арабика.
Как сообщает Sci News, в рамках нового исследования ученые создали эталонный геном самого популярного в мире вида кофе - арабика (Coffea arabica). Изучение генома показало, что он появился более 600 тысяч лет назад в лесах современной Эфиопии.
Установлено также, что он был гибридом - арабика появилась в результате естественного скрещивания двух других видов кофе: Coffea eugenioides и Coffea canephora. На протяжении многих тысячелетий в зависимости от изменений климата популяция арабики увеличивалась или уменьшалась. Но растение выжило, успешно прошло долгий эволюционный путь и сейчас является сырьем для 60 процентов мирового производства кофе.
"Мы использовали геномную информацию о современных растениях, чтобы вернуться в прошлое и нарисовать максимально точную картину долгой истории арабики, а также определить, как современные культивируемые сорта связаны друг с другом", - говорит профессор Виктор Альберт из Университета Баффало.
По его словам, эталонный геном был создан с использованием передовой технологии секвенирования ДНК и передовых методов анализа данных. Всего команде профессора Альберта удалось секвенировать 39 сортов арабики, в том числе образец XVII века, который изучал шведский натуралист Карл Линней.
Было установлено, что вид Coffea arabica в результате естественной гибридизации получил по два набора хромосом от каждого своего "родителя". Для датирования было применено компьютерное моделирование. Первоначально разброс дат был довольно большим: предварительные оценки возраста арабики варьировались от 10 тысяч до 1 миллиона лет.
Моделирование выявило три хронологических периода, когда популяция арабики была минимальной. Старейший из них начался около 610 тысяч лет назад. С тех пор арабика пережила уже 29 тысяч поколений. Но оценка возраста пока не является окончательной. Авторы работы предполагают, что возраст арабики может достигать 1 миллиона лет, но это подтвердят или опровергнут последующие исследования.
Полностью научная работа опубликована в журнале Nature Genetics.